Ons laboratorium

De werkzaamheden op ons laboratorium zijn gericht op de negatieve gevolgen die micro-organismen op de omgeving kunnen hebben. Zo doen wij bijvoorbeeld onderzoek naar MIC corrosie en biofilms, maar ook naar pathogenen.

MIC corrosie en biofilms

In het laboratorium onderzoeken we de micro‑organismen die verantwoordelijk zijn voor  biofilmvorming en MIC (microbiologically influenced corrosion). We doen dat in allerlei typen monsters: water, bodem, oppervlaktes en corrosieproducten. Naast het identificeren van micro‑organismen onderzoeken we ook welke omgevingsfactoren ongewenst microbiële activiteit bevorderen.  Door verwerking van de analyseresultaten met onze eigen dataverwerkingstool brengen we deze processen in kaart, zodat klanten inzicht krijgen in de gevolgen van risico’s zoals materiaalverlies, verstoppingen en procesverstoringen.

Detectie van pathogenen

Naast onderzoek naar MIC en microbiële verstoppingen bieden wij ook detectie van pathogenen aan. In elke operationele omgeving is er kans op ongewenste microbiële indringers die voor veel problemen kunnen zorgen.  We brengen gericht in kaart of er pathogene micro-organismen aanwezig zijn en of deze een risico vormen voor processen of gezondheid. Dankzij de toepassing van DNA/RNA analyses bent u niet langer afhankelijk van de kweekbaarheid van de pathogenen, zoals bij de traditionele methoden. Daardoor wordt een veel bredere diagnose mogelijk en meer inzicht verkregen. Dankzij NGS kan ook verder gekeken worden dan de standaard pathogenen. U krijgt snel duidelijkheid bij verdenking van een besmetting en advies om passende maatregelen te nemen.

Divider icon

Diagnostische tools voor microbiële activiteiten

Afhankelijk van de onderzoeksvraag zetten we verschillende diagnostische tools in om de microbiële activiteit te analyseren.

qPCR-analyse

qPCR is een kwantitatieve meting van DNA en RNA waarmee je een vooraf gekozen doelorganisme of doelproces in aantallen bepaalt. In tegenstelling tot kweek detecteert qPCR ook de niet kweekbare micro-organismen (ongeveer 99% van wat er in de natuur voorkomt). Hierdoor krijgt u een betrouwbaar beeld van microbiële activiteit in leidingen, installaties en watersystemen etc. Een belangrijk voordeel is dat monsters in het veld kunnen worden gefixeerd, zodat de microbiologie niet verandert tijdens transport.

vPCR – analyse van levensvatbare micro-organismen

vPCR lijkt op qPCR, maar richt zich specifiek op de levensvatbare micro-organismen: de cellen die nog actief zijn of weer actief kunnen worden, zoals sporen. De methode wordt altijd samen met qPCR uitgevoerd en laat zien welk deel van de micro-organismen in een monster echt nog “meedoet”. Omdat vPCR — net als qPCR — kijkt naar genetisch materiaal, ben je niet beperkt tot wat kweekbaar is. Wel moeten monsters voor vPCR vers worden aangeleverd, omdat ze niet kunnen worden gefixeerd.

Next-generation sequencing (NGS)

NGS is een tool die we gebruiken om alle micro‑organismen in een monster te vinden, zelfs de soorten die we nog niet kennen. Het geeft ons geen exacte aantallen, maar laat wel zien welke groepen meer of minder aanwezig zijn. Met 16S amplicon sequencing maken we een kaart van de microbiële populatie en zien we welke rol de micro‑organismen spelen in een proces. De resultaten kunnen we bijvoorbeeld gebruiken om qPCR‑analyses te ontwikkelen voor monitoring. Met Total RNA sequencing kunnen we zelfs alle organismen én hun activiteit analyseren zonder vooraf een doel te hoeven kiezen.

Next-generation sequencing met de Illumina MiSeq i100

Voor onze NGS-analyses gebruiken we de Illumina MiSeq i100, een van de nieuwste compacte NGS-platforms. Dit systeem levert hoge datakwaliteit, betrouwbare DNA-profielen en snelle doorlooptijden. Hierdoor kunnen we klanten tijdig voorzien van diepgaande microbiële analyses en goed onderbouwde rapportages.

Is hergebruik van overstortbaggerslib veilig?

Overstortbagger is bagger die in de buurt van een riooloverstort uit sloten en kanalen wordt gehaald. Deze bagger is vaak vervuild, doordat bij hevige regenval rioolwater en slib in de overstort stroomt. Jaarlijks zorgt het afvoeren van dit mogelijk vervuilde baggerslib voor behoorlijk hoge kosten. Daarom heeft het waterschap Noorderzijlvest Bioclear earth in samenwerking met Microbial Analysis de opdracht gegeven om te onderzoeken of het veilig is om dit slib op een duurzame manier te hergebruiken. Voor het waterschap is belangrijk om te weten hoe snel eventuele ziekteverwekkende micro-organismen en medicijnresten uit de modder van riooloverstorten verdwijnen. . 

Lees meer

Bemonsteringskits voor microbiologisch onderzoek

Voor een betrouwbare microbiële analyse kunt u eenvoudig een bemonsteringskit bij ons bestellen. Binnen één werkdag ontvangt u alle benodigde materialen en een duidelijk bemonsteringsprotocol. De kit kan ongekoeld naar ons worden teruggestuurd.

Na ontvangst van het monster ontvangt u binnen tien werkdagen een analyserapport per e-mail. Bij spoed kunnen wij, tegen meerprijs, binnen 48 uur rapporteren.

Wilt u niet zelf bemonsteren? Onze specialisten kunnen de bemonstering volledig voor u uitvoeren.